《暮光之城》

DOI:10.18129 / B9.bioc.twilight

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅《暮光之城》。

估计当地的错误发现率

Bioconductor版本:3.10

在一个典型的微阵列设置与基因表达数据在两个条件下,观察当地的错误发现率的概率描述两个条件之间的基因差异表达不是由于其作相应分数或假定值水平。假定值的结果曲线与当地的错误发现率提供了一个洞察清楚之间的模糊状态微分和明确non-differential基因表达。《暮光之城》包包含两个主要功能:《暮光之城》的功能。pval上执行一个双态测试的差异意味着对于一个给定的输入矩阵或表达式设置和计算基于排列的假定值。《暮光之城》的执行一个函数随机下坡搜索估计本地错误发现率和粒径分布的影响。包进一步提供意味着过滤排列正确描述零分布。使用过滤后的排列,隐藏的混杂因素的影响可能被削弱。

作者:斯蒂芬妮Scheid <斯蒂芬妮。在gmx.de scheid >

维护人员:斯蒂芬妮Scheid <斯蒂芬妮。在gmx.de scheid >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(《暮光之城》)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	估计当地的错误发现率
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparison,软件
版本	1.62.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 15年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 2.10),样条函数(> = 2.2.0),数据(> = 2.2.0),Biobase(> = 1.12.0)
进口	Biobase、图形、grDevices统计数据
链接
建议	golubEsets(> = 1.4.2),vsn(> = 1.7.2)
SystemRequirements
增强了
URL	http://compdiag.molgen.mpg.de/software/twilight.shtml
取决于我	OrderedList
进口我	OrderedList
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	twilight_1.62.0.tar.gz
Windows二进制	twilight_1.62.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	twilight_1.62.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/twilight
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/暮光之城
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/twilight/
包下载报告	下载数据