tspair

DOI:10.18129 / B9.bioc.tspair

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅tspair。

最高得分对芯片的分类

Bioconductor版本:3.10

这些函数计算两个基因的排名显示的最大区别两个用户指定的组。这个“最高得分对”最大化敏感性和特异性的平均值在所有等级建立分类器使用一对基因数据集。基于分类样本的优势只有一对基因的相对排名(a)分类器是简单得多,通常比更复杂更可判断的分类方案和(b)如果数组可以使用只有一对基因分类,基于PCR的检测可用于分类的样本。看到参考tspcalc()函数获得有关TSP分类器的引用。

作者:杰弗里·t .韭菜< jtleek jhu.edu >

维修工:杰弗里·t .韭菜< jtleek jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tspair”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“tspair”)

PDF	R脚本	tspTutorial
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,软件
版本	1.44.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(11年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10),Biobase(> =测试盒框)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	tspair_1.44.0.tar.gz
Windows二进制	tspair_1.44.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	tspair_1.44.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tspair
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tspair
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tspair/
包下载报告	下载数据