三人组

doi：10.18129/b9.bioc.trio

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅三人组。

在病例三重奏研究中测试SNP和SNP相互作用

生物导体版本：3.10

测试SNP和SNP与基因型TDT的相互作用。此软件包还包含用于计算LD度量的成对值和识别LD块的函数，以及用于设置匹配的病例的伪伪基因型基因型数据，以便运行三重奏逻辑回归，以便运行三重奏逻辑回归，以插入丢失的基因型中的基因型。三重奏，用于模拟与SNP相互作用的疾病风险以及三重奏数据中的功率和样本计算的疾病风险。

作者：Holger Schwender，Qing Li，Philipp Berger，Christoph Neumann，Margaret Taub，Ingo Ruczinski

维护者：Holger Schwender

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ trio”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“三重奏”）

PDF	R脚本	三人逻辑回归和基因型TDT
PDF		参考手册

细节

生物浏览	遗传因素，，，，遗传学，，，，微阵列，，，，SNP，，，，软件
版本	3.24.3
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（6。5年）
执照	LGPL-2
要看	R（> = 3.0.1）
进口	grdevices，图形，方法，统计，生存，utils，siggenes，，，，逻辑（> = 1.6.1）
链接
建议	haplo.stats，，，，McBiopi，花键，逻辑（> = 1.28.1），克恩斯门茶，，，，变体
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	trio_3.24.3.3.tar.gz
Windows二进制	trio_3.24.3.3.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	trio_3.24.3.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trio
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/三人组
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/trio/
软件包下载报告	下载统计