tr

DOI:10.18129 / b9.bioc.trim.

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅tr

Triform在转录因子芯片测序数据中发现富集的地区(峰值)

生物导体版本:3.10

Triform算法使用无模型统计数据来识别TF芯片测序读取的峰值分布,利用与已知的概况特性的改进的峰值定义。

作者:Karl Kornacker Developer [Aut],Tony Handstad Developer [Aut,CRE]

维护者:Gmail.com的Thomas Carroll

引文(从R内,输入引文(“Triform”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“3.6”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“triform”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“TRIFSIC”)

PDF. r script. Triform用户指南
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. chipseq.测序软件
版本 1.28.0
在生物导体中以来 BIOC 2.11(R-2.15)(7.5岁)
执照 GPL-2
依靠 r(> = 2.11.0),绞喉yaml.
进口 生物根系绞喉(> = 2.5.27),yaml.
链接到
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取决于我
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包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 triford_1.28.0.tar.gz.
Windows二进制文件 triform_1.28.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) triform_1.28.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocondudard.org/packages/triform.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/三方形
包短网址 https://biocumon.org/packages/trics/
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