Traser

doi:10.18129/b9.bioc.traser

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Traser

与GWAS性状相关的SNP富集分析在基因组间隔

生物导体版本:3.10

Traser使用不同的假设测试方法在基因组间隔进行了与GWAS性状相关的SNP富集分析,还提供了各种功能来探索和可视化结果。

作者:Li Chen,Zhaohui S.Qin

维护者:li chen

引用(从r内,输入引用(“ Traser”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ traser”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Traser”)

PDF R脚本 在基因组间隔进行GWAS性状相关的SNP富集分析
PDF 参考手册

细节

生物浏览 结盟,,,,覆盖范围,,,,DataImport,,,,遗传学,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(4。5年)
执照 GPL
要看 r(> = 3.2.0),基因组机,,,,iranges,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
进口
链接
建议 生物使用,,,,运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
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构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 traser_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 traser_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) traser_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/traser
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/traser
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/traser/
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