跨石
doi：10.18129/b9.bioc.transite
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅跨石。
RNA结合蛋白基序分析
生物导体版本：3.10
Transite是一种计算方法，可以通过利用先前存在的基因表达数据和RNA结合蛋白结合偏好的当前知识来全面分析RNA结合蛋白在各种细胞过程中的调节作用。
作者：Konstantin Krismer [AUT，CRE，CPH]
，Anna Gattinger [aut]，迈克尔·耶夫[THS，CPH]，伊恩·坎内尔[THS]
维护者：MIT.edu的Konstantin Krismer
引用（从r内，输入引用（“跨石”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ transite”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ transite”）
| html | R脚本 | 频谱基序分析（SPMA） |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，遗传学，，，，微阵列，，，，软件，，，，转录，，，，Mrnamicroarray |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（1。5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 3.5） |
| 进口 | 生物基因（> = 0.26.0），生物弦（> = 2.48.0），dplyr（> = 0.7.6），基因组机（> = 1.32.6），GGPLOT2（> = 3.0.0），ggseqlogo（> = 0.1），栅格（> = 2.3），方法，并行，RCPP（> = 0.12.18），秤（> = 1.0.0），统计，TFMPVALUE（> = 0.0.8），UTILS |
| 链接 | RCPP（> = 0.12.18） |
| 建议 | 尼特（> = 1.20），rmarkDown（> = 1.10），roxygen2（> = 6.1.0） |
| 系统要求 | C ++ 11 |
| 增强 | |
| URL | https://transite.mit.edu |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | transite_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | transite_1.4.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | transite_1.4.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transite |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/跨矿石 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/transite/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
