transcriptogramer

DOI:10.18129 / B9.bioc.transcriptogramer

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见transcriptogramer．

基于转录图的转录分析

Bioconductor版本:3.10

R包用于基于转录图的转录分析，这是一种分析转录组的方法，将表达值投射到一组有序蛋白质上，其排列方式是基因产物参与同一代谢途径的概率随着排序的两个蛋白质之间距离的增加而呈指数下降。因此，转录谱是全基因组的基因表达谱，为细胞代谢提供了一个全局视图，同时表明其表达被改变的基因集。

作者:Diego Morais [aut, cre]， Rodrigo Dalmolin [aut]

维护者:Diego Morais

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“transcriptogramer”)

超文本标记语言	R脚本	转录仪用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，ImmunoOncology，微阵列，网络，RNASeq，软件，SystemsBiology，转录，可视化
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(2.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 3.4)，方法
进口	biomaRt，data.table，doSNOW，foreach，ggplot2，图形，grDevices，igraph，limma平行,进步，红色的，雪统计数据,tidyr，topGO
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements	Java运行时环境(>= 6)
增强了
URL	https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer
BugReports	https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	transcriptogramer_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	transcriptogramer_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	transcriptogramer_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transcriptogramer
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/transcriptogramer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/transcriptogramer/
软件包下载报告	下载数据