这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅topGO。
Bioconductor版本:3.10
topGO包提供的工具测试条件而占的拓扑图形。不同的测试数据和不同的方法来消除局部相似性和条件可以实现和应用之间的依赖关系。
作者:Jorg Rahnenfuhrer Adrian Alexa
维护人员:阿德里安Alexa <艾德里安。alexa gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“topGO”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“topGO”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“topGO”)
R脚本 | topGO | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,软件,可视化 |
版本 | 2.38.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.0 (r - 2.5)(13岁) |
许可证 | LGPL |
取决于 | R(> = 2.10.0)、方法BiocGenerics(> = 0.13.6),图(> = 1.14.0),Biobase(> = 2.0.0),GO.db(> = tripwire),AnnotationDbi(> = 1.7.19),SparseM(> = 0.73) |
进口 | 晶格,matrixStats,DBI |
链接 | |
建议 | 所有,hgu95av2.db,hgu133a.db,genefilter,xtable,乘,Rgraphviz,globaltest |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | BgeeDB,ccTutorial,cellTree,compEpiTools,EGSEA,理想的,KnowSeq,maEndToEnd,美国广播公司,RNAither,tRanslatome |
进口我 | cellity,EnrichmentBrowser,FoldGO,GOSim,OmaDB,pcaExplorer,psygenet2r,transcriptogramer,ViSEAGO |
建议我 | FGNet,IntramiRExploreR,miRNAtap,林格 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | topGO_2.38.1.tar.gz |
Windows二进制 | topGO_2.38.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | topGO_2.38.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/topGO |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ topGO |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/topGO/ |
包下载报告 | 下载数据 |