tRNAscanImport

DOI:10.18129 / B9.bioc.tRNAscanImport

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见tRNAscanImport．

导入tRNAscan-SE结果文件作为GRanges对象

Bioconductor版本:3.10

该包将tRNAscan-SE的结果作为GRanges对象导入。

作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]

维护人员:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com >

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“tRNAscanImport”)

超文本标记语言	R脚本	tRNAscanImport
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，预处理，软件，可视化，WorkflowStep
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (R-3.5)(2年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 3.5),GenomicRanges，tRNA
进口	方法,自信的，stringr，BiocGenerics，Biostrings，Structstrings，S4Vectors，IRanges，XVector，GenomeInfoDb，rtracklayer，BSgenome，Rsamtools
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，ggplot2，BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport/issues
取决于我
进口我
建议我	Structstrings，tRNA
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	tRNAscanImport_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	tRNAscanImport_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	tRNAscanImport_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tRNAscanImport
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tRNAscanImport
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tRNAscanImport/
包下载报告	下载数据