此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见survtype.
Bioconductor版本:3.10
亚型被定义为具有不同分子和临床特征的样本组。通过分析基因组数据,可以发现患者亚型,并与临床数据,特别是生存信息相关联。该软件包旨在识别临床相关和生物学意义的亚型。
作者:Jung Dongmin
维护者:Dongmin Jung
引文(从R内,输入引用(“survtype”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("survtype")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“survtype”)
超文本标记语言 | R脚本 | survtype |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,报道,GeneExpression,测序,软件,StatisticalMethod,生存 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(1年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | SummarizedExperiment,pheatmap,生存,survminer,clustvarsel,统计,效用 |
进口 | |
链接 | |
建议 | maftools,尺度,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | survtype_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | survtype_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | survtype_1.2.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/survtype |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/survtype |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/survtype/ |
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