经验丰富的人

DOI:10.18129 / B9.bioc.stageR

这个包是3.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本，请参见经验丰富的人。

stagger: R .基因高通量表达数据的分期分析

Bioconductor版本:3.10

stagger包允许对高通量基因表达数据进行自动阶段分析。该方法发表在https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-017-1277-0的基因组生物学上

作者:Koen Van den Berge和Lieven Clement

维护者:Koen Van den Berge < Koen。在gmail.com vdberge >

安装

要安装此包，请启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("stageR")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“经验丰富的人”)

超文本标记语言	R脚本	分期分析:R .基因高通量表达数据的分期分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件,StatisticalMethod
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(2.5年)
许可证	GNU通用公共许可证第3版
取决于	R (> = 3.4),SummarizedExperiment
进口	方法,统计数据
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle、方法、Biobase,刨边机,limma,DEXSeq,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	rnaseqDTU
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	stageR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	stageR_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	stageR_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stageR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/经验丰富的人
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/stageR/
包下载报告	下载数据