splineTimeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.splineTimeR

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅splineTimeR。

时间进程差异基因表达数据分析使用样条回归模型基因协会网络重建紧随其后

Bioconductor版本:3.10

这个包提供了功能基因表达差异基因表达分析的时间进程的数据。自然三次样条回归模型。识别基因可能会进一步被用于通路富集分析和/或时间的重建协会相关的基因调控网络。

作者:Agata Michna

维护人员:赫伯特Braselmann < braselm在helmholtz-muenchen.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“splineTimeR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“splineTimeR”)

PDF	R脚本	splineTimeR
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,NetworkEnrichment,NetworkInference,回归,软件,TimeCourse
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3),Biobase,igraph,limma,GSEABase,gtools样条函数,GeneNet(> = 1.2.13),纵向(> = 1.1.12),金融中间人
进口
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	splineTimeR_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	splineTimeR_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	splineTimeR_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splineTimeR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ splineTimeR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/splineTimeR/
包下载报告	下载数据