此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见寄居.
Bioconductor版本:3.10
单分子跟踪已经发展成为一种补充基因组测序的新方法,它报告了被研究分子的活生物物理性质,除了与它们的编码序列有关的性质外;在这里,我们提供了“旅居者”包,以解决与分析和理解高通量单分子跟踪数据相关的统计和生物信息学需求。
作者:Liu Sheng [aut], Sun Jay Yoo [aut], Tang Xiao Na [aut], Young Soo Sung [aut], Carl Wu [aut], Anand Ranjan [ctb], Vu Nguyen [ctb], Sojourner Developer [cre]
维护者:Sojourner Developer < Sojourner . Developer at outlook.com>
引文(从R内,输入引用(“寄居”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("sojourner")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“寄居”)
超文本标记语言 | R脚本 | Sojourner:用于单分子轨迹统计分析的R包 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件,技术,WorkflowStep |
版本 | 1.0.2中 |
在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | ggplot2,dplyr,reshape2,gridExtra,EBImage,质量,R.matlab,Rcpp,引导,fitdistrplus,mclust,minpack.lm,mixtools,mltools,nls2,plyr,rtiff,sampSurf,尺度,闪亮的,shinyjs,sp,truncnorm, utils,统计,象图,rlang,图形,grDevices,网格,编译器,晶格 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/sheng-liu/sojourner |
BugReports | https://github.com/sheng-liu/sojourner/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | sojourner_1.0.2.tar.gz |
Windows二进制 | sojourner_1.0.2.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | sojourner_1.0.2.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sojourner |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/sojourner |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/sojourner/ |
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