此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅snpstats。
生物导体版本:3.10
大型SNP关联研究的类和统计方法。这扩展了早期的SNPMATRIX软件包,从而允许基因型的不确定性。
作者:David Clayton
维护者:David Clayton
引用(从r内,输入引用(“ snpstats”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ snpstats”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ snpstats”)
R脚本 | 数据输入 | |
R脚本 | FST | |
R脚本 | 插补和荟萃分析 | |
R脚本 | LD统计 | |
R脚本 | 主要组件分析 | |
snpmatrix-differences | ||
R脚本 | SNPSTATS简介 | |
R脚本 | TDT测试 | |
参考手册 |
生物浏览 | 遗传因素,,,,微阵列,,,,SNP,,,,软件 |
版本 | 1.36.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.8(R-2.13)(9年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 2.10.0),生存,,,,矩阵, 方法 |
进口 | 图形,grdevices,统计,utils,生物基因,,,,Zlibbioc |
链接 | |
建议 | Hexbin |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | eqtl,,,,GGBASE,,,,ggdata |
进口我 | funcisnp,,,,Genegeneinter,,,,ggtools,,,,gqtlstats,,,,ldblock,,,,马提尼,,,,RVS,,,,Scoreinvhap |
建议我 | crlmm,,,,Gwascat,,,,Gwastools,,,,Omicrexposom,,,,OMICSPRINT,,,,变体 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | snpstats_1.36.0.tar.gz |
Windows二进制 | snpstats_1.36.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snpstats |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/snpstats |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/snpstats/ |
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