激流回旋
doi：10.18129/b9.bioc.slalom
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅激流回旋。
单细胞RNA-seq数据的阶乘潜在变量建模
生物导体版本：3.10
激流回旋是单细胞RNA-seq数据的可扩展建模框架，它使用基因集注释来解剖单细胞转录组异质性，从而允许识别细胞间隙变异性和模型混淆因子的生物驱动因素。
作者：Florian Buettner [AUT]，Naruemon Pratanwanich [AUT]，Davis McCarthy [Aut，Cre]，John Marioni [Aut]，Oliver Stegle [AUT]
维护者：戴维斯·麦卡锡（Davis McCarthy）
引用（从r内，输入引用（“隆隆”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ slalom”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“激流环”）
| html | R脚本 | 激流回旋简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 维度，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，正常化，，，，rnaseq，，，，Reactome，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学，，，，可视化 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（2。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | R（> = 3.4） |
| 进口 | RCPP（> = 0.12.8），rcpparmadillo，，，，BH，，，，GGPLOT2， 网格，gseabase， 方法，RSVD，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，统计 |
| 链接 | RCPP，，，，rcpparmadillo，，，，BH |
| 建议 | 尼特，，，，RHDF5，，，，评分，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Slalom_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Slalom_1.8.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Slalom_1.8.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/slalom |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/激流回旋 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/slalom/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
