siggenes

doi:10.18129/b9.bioc.siggenes

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅siggenes

使用SAM和EFRON的经验贝叶斯方法进行多次测试

生物导体版本:3.10

使用微阵列(SAM)的显着性分析和微阵列(EBAM)的经验贝叶斯分析,鉴定出差异表达的基因和错误发现率(FDR)的估计。

作者:Holger Schwender

维护者:Holger Schwender

引用(从r内,输入引用(“ Siggenes”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ siggenes”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Siggenes”)

html 识别.sam.html
html plot.ebam.html
html plot.finda0.html
html plot.sam.html
html print.ebam.html
html print.finda0.html
html print.sam.html
PDF R脚本 Siggenes手册
PDF siggenesrnews.pdf
html summary.ebam.html
html summary.sam.html
PDF 参考手册

细节

生物浏览 差异性,,,,exonarray,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,SNP,,,,软件
版本 1.60.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 15年)
执照 LGPL(> = 2)
要看 生物酶,,,,多检验,花键,方法
进口 Stats4,Grdevices,Graphics,Stats,scrime(> = 1.2.5)
链接
建议 副词,,,,注释,,,,GeneFilter,,,,克恩斯门茶
系统要求
增强
URL
取决于我 KCSMART
进口我 coexnet,,,,达帕尔,,,,Desousa2013,,,,Minfi,,,,三人组,,,,XDE
建议我 逻辑
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 siggenes_1.60.0.tar.gz
Windows二进制 siggenes_1.60.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Siggenes_1.60.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/siggenes
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/siggenes
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/siggenes/
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