SigPathway.

DOI:10.18129 / b9.bioc.sigpatpway.

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅SigPathway.

途径分析

生物导体版本:3.10

通过计算Tian等人所述的NT_K和NE_K统计来进行途径分析。(2005)

作者:威尔赖(优化R和C代码),陆天和彼得公园(算法开发和初始R代码)

维护者:Weil Lai

引文(从R内,输入引文(“Sigpatpway”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“3.6”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“sigpatpway”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“Sigpathway”)

PDF. r script. SigPathway.
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 不同的亚兴多匹匹莫森软件
版本 1.54.0
在生物导体中以来 BIOC 1.9(R-2.4)(13.5岁)
执照 GPL-2
依靠 r(> = 2.10)
进口
链接到
建议 hgu133a.db.(> = 1.10.0),XML.(> = 1.6-3),annotationdbi.(> = 1.3.12)
系统要求
加强
URL. http://www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.0506577102http://www.chip.org/~ppark/supplements/pnas05.html.
取决于我 翻译
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 sigpathway_1.54.0.tar.gz.
Windows二进制文件 sigpathway_1.54.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) sigpathway_1.54.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/sigpatpway.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ sigpatpway
包短网址 https://biocumon.org/packages/sigpathway/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

请阅读张贴指南。将关于Biocometiond的问题发布到以下位置之一:

  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • 正常词 邮件列表 - 适用于包开发人员bob电竞体育官网