shinyMethyl

DOI:10.18129 / B9.bioc.shinyMethyl

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅shinyMethyl

交互式可视化的Illumina公司甲基化数组

Bioconductor版本:3.10

交互式可视化的工具Illumina公司甲基化数组的数据。支持450 k和史诗数组。

作者:让-菲利普•福丁(cre, aut], Kasper丹尼尔·汉森(aut)

维护人员:让-菲利普•福丁< jfortin jhsph.edu >

从内部引用(R,回车引用(“shinyMethyl”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“shinyMethyl”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“shinyMethyl”)

PDF R脚本 shinyMethyl:交互式的可视化Illumina公司450 k甲基化数组
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(5.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),闪亮的(> = 0.13.2),minfi(> = 1.18.2),IlluminaHumanMethylation450kmanifest,matrixStatsR (> = 3.0.0)
进口 RColorBrewer
链接
建议 shinyMethylData,minfiData,BiocStyle,RUnit,消化,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 shinyMethyl_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 shinyMethyl_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) shinyMethyl_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/shinyMethyl
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ shinyMethyl
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/shinyMethyl/
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