此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅芝麻。
生物导体版本:3.10
用于分析Illumina Infinium DNA甲基化阵列的工具。
作者:徘徊周[AUT,CRE],Hui Shen [AUT],Timothy Triche [CTB],Bret Barnes [CTB]
维护者:在gmail.com>
引用(从r内,输入引用(“芝麻”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ sesame”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“芝麻”)
html | R脚本 | 0.芝麻用户指南 |
html | R脚本 | 1.质量控制 |
html | R脚本 | 2.大数据 |
html | R脚本 | 3. MinFi相互作用 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | DNAMETHYLATY,,,,甲基化array,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(1。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | r(> = 3.6),Sesamedata, 方法 |
进口 | 生物比较,,,,R6,grdevices,utils,Illuminaio,,,,大量的,,,,基因组机,,,,iranges, 网格,预处理,统计S4VECTORS,,,,Randomforest,,,,小麦图,,,,GGPLOT2, 平行,矩阵,,,,DNACOPIGY |
链接 | |
建议 | 秤,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,Minfi,,,,总结性特征,,,,Flowsorted.cordbloodnorway.450k,,,,Flowsorted.blood.450k,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/zwdzwd/sesame |
BugReports | https://github.com/zwdzwd/sesame/issues |
取决于我 | |
进口我 | tcgabiolinksgui |
建议我 | Sesamedata,,,,tcgabiolinks |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | sesame_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | sesame_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | sesame_1.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sesame |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/芝麻 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/sesame/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |