芝麻

doi:10.18129/b9.bioc.sesame

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅芝麻

分析Illumina Infinium DNA甲基化阵列的工具

生物导体版本:3.10

用于分析Illumina Infinium DNA甲基化阵列的工具。

作者:徘徊周[AUT,CRE],Hui Shen [AUT],Timothy Triche [CTB],Bret Barnes [CTB]

维护者:在gmail.com>

引用(从r内,输入引用(“芝麻”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ sesame”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“芝麻”)

html R脚本 0.芝麻用户指南
html R脚本 1.质量控制
html R脚本 2.大数据
html R脚本 3. MinFi相互作用
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,甲基化array,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(1。5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 r(> = 3.6),Sesamedata, 方法
进口 生物比较,,,,R6,grdevices,utils,Illuminaio,,,,大量的,,,,基因组机,,,,iranges, 网格,预处理,统计S4VECTORS,,,,Randomforest,,,,小麦图,,,,GGPLOT2, 平行,矩阵,,,,DNACOPIGY
链接
建议 ,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,Minfi,,,,总结性特征,,,,Flowsorted.cordbloodnorway.450k,,,,Flowsorted.blood.450k,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/zwdzwd/sesame
BugReports https://github.com/zwdzwd/sesame/issues
取决于我
进口我 tcgabiolinksgui
建议我 Sesamedata,,,,tcgabiolinks
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 sesame_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 sesame_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) sesame_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sesame
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/芝麻
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/sesame/
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