SCDS

doi:10.18129/b9.bioc.scds

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅SCDS

单细胞RNA测序数据的双重拨圈的核内注释

生物导体版本:3.10

在单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ)中,细胞的数据组合有时被认为是单个细胞(Doublets)。SCDS软件包提供了在SCRNA-SEQ数据中计算中注释双重组的方法。

作者:Dennis Kostka [AUT,CRE],Bais Abha [AUT]

维护者:dennis kostka

引用(从r内,输入引用(“ SCD”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ scds”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ SCD”)

html R脚本 SCDS包的简介
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 分类,,,,基因表达,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(1年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.6.0)
进口 矩阵,,,,S4VECTORS,,,,Singlecellexperiment,,,,总结性特征,,,,xgboost,方法,统计,dplyr,,,,Proc
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,RSVD,,,,RTSNE,,,,评分,,,,牛仔图
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

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源包 scds_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 scds_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) scds_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scds
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/scds
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/scds/
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