scTGIF

DOI:10.18129 / B9.bioc.scTGIF

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见scTGIF

未注释单细胞RNA-Seq数据的细胞类型注释

Bioconductor版本:3.10

scTGIF连接细胞和相关基因功能,不需要细胞类型标记。

作者:Tsuyuzaki Koki [aut, cre]

维护人员:Koki Tsuyuzaki

引文(从R内,输入引用(“scTGIF”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“scTGIF”)

超文本标记语言 R脚本 scTGIF
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DimensionReductionGeneExpression质量控制SingleCell软件
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.6.0)
进口 GSEABaseBiobaseSingleCellExperimentBiocStyle情节tagcloudrmarkdownRcpp, grDevices,图形,utils,knitrS4VectorsSummarizedExperimentRColorBrewernnTensor、方法、尺度msigdbr
链接
建议 testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 scTGIF_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 scTGIF_1.0.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) scTGIF_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scTGIF
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scTGIF
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scTGIF/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网