scTGIF

DOI:10.18129 / B9.bioc.scTGIF

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见scTGIF．

未注释单细胞RNA-Seq数据的细胞类型注释

Bioconductor版本:3.10

scTGIF连接细胞和相关基因功能，不需要细胞类型标记。

作者:Tsuyuzaki Koki [aut, cre]

维护人员:Koki Tsuyuzaki

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“scTGIF”)

超文本标记语言	R脚本	scTGIF
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction，GeneExpression，质量控制，SingleCell，软件
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	GSEABase，Biobase，SingleCellExperiment，BiocStyle，情节，tagcloud，rmarkdown，Rcpp， grDevices，图形，utils，knitr，S4Vectors，SummarizedExperiment，RColorBrewer，nnTensor、方法、尺度，msigdbr
链接
建议	testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	scTGIF_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	scTGIF_1.0.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	scTGIF_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scTGIF
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scTGIF
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scTGIF/
软件包下载报告	下载数据