此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见scDblFinder.
Bioconductor版本:3.10
利用基于超聚类的人工双态生成直接从计数中有效识别单细胞RNAseq中的双态。
作者:Pierre-Luc Germain [cre, aut]
维护者:Pierre-Luc Germain < Pierre-Luc。日耳曼在hest.ethz.ch>
引文(从R内,输入引用(“scDblFinder”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("scDblFinder")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“scDblFinder”)
超文本标记语言 | R脚本 | scDblFinder |
参考手册 |
biocViews | 预处理,RNASeq,SingleCell,软件 |
版本 | 1.1.8 |
在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.6) |
进口 | igraph,矩阵,matrixStats,BiocParallel,BiocNeighbors,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,食物,嘘,data.table,dplyr,ggplot2,randomForest,图形,方法,统计,DelayedArray |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/plger/scDblFinder |
BugReports | https://github.com/plger/scDblFinder/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | scDblFinder_1.1.8.tar.gz |
Windows二进制 | scDblFinder_1.1.8.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | scDblFinder_1.1.8.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scDblFinder |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scDblFinder |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scDblFinder/ |
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