sRAP

DOI:10.18129 / B9.bioc.sRAP

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅sRAP。

简化RNA-Seq分析管道

Bioconductor版本:3.10

这个包提供了一个管道用于基因表达分析(主要是RNA-Seq数据)。正常化是RNA-Seq分析特定的函数,但所有其他功能(质量控制数据,微分和可视化表达,和功能性浓缩通过BD-Func)将与任何类型的基因表达数据。

作者:查尔斯·沃登

维护人员:查尔斯·沃登在gmail.com < cwarden45 >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“被”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“被”)

PDF	R脚本	sRAP装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,去,GeneExpression,GeneSetEnrichment,微阵列,预处理,质量控制,RNAseq,软件,统计数据,可视化
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	WriteXLS
进口	gplots,请,ROCR,qvalue
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	sRAP_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	sRAP_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	sRAP_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sRAP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sRAP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sRAP/
包下载报告	下载数据