rqt

DOI:10.18129 / B9.bioc.rqt

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见rqt．

Rqt:用于基因级元分析的实用程序

Bioconductor版本:3.10

尽管现代GWAS方法近年来取得了一些进展，但如何计算整个基因的效应量和相应的p值仍然是一个重要的问题，而不是单个变异。R包rqt提供了基因水平的GWAS元分析。更多信息请参见:Lee等人(2016)的“下一代测序数据的基因集关联测试”，生物信息学，32(17)，i611-i619， ．

作者:I. Y.日班尼科夫，K. G.阿尔别夫，A. I.雅辛。

维护者:Ilya Y. Zhbannikov < Ilya。Zhbannikov在duke.edu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rqt")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rqt”)

超文本标记语言	R脚本	rqt包的教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GenomeWideAssociation，PrincipalComponent，回归，测序，软件，StatisticalMethod，生存
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(3年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 3.4)，SummarizedExperiment
进口	统计数据,矩阵，ropls、方法、车，RUnit，metap，CompQuadForm，glmnet跑龙套,请
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/izhbannikov/rqt
BugReports	https://github.com/izhbannikov/rqt/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rqt_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	rqt_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rqt_1.12.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rqt
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rqt
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rqt/
软件包下载报告	下载数据