咆哮

DOI:10.18129 / B9.bioc.roar

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅咆哮

从RNA-seq比对确定微分APA使用

Bioconductor版本:3.10

确定优先使用APA网站,比较两个生物条件,从已知的替代标准RNA-seq试验得到网站和比对。

作者:埃琳娜格拉希

维护人员:埃琳娜·葛拉<葛。在gmail.com e >

从内部引用(R,回车引用(“咆哮”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“咆哮”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“咆哮”)

PDF R脚本 从RNA-seq比对确定微分APA使用
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews HighThroughputSequencing,RNAseq,测序,软件,转录
版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 2.14 (r - 3.1)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.0.1)
进口 方法,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,SummarizedExperiment,GenomicAlignments(> = 0.99.4),rtracklayer,GenomeInfoDb
链接
建议 RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14,testthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/vodkatad/roar/
取决于我
进口我 XBSeq
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 roar_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 roar_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) roar_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/roar
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/咆哮
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/roar/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网