rnaseqcomp

DOI:10.18129 / B9.bioc.rnaseqcomp

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见rnaseqcomp．

RNA-seq定量管道的基准

Bioconductor版本:3.10

RNA-seq定量管道的几个定量和可视化基准。为了进行评估，每个管道对基因、转录本、连接或外显子的双条件量化应组织成数字矩阵。

作者:滕明祥，Rafael A. Irizarry

维护人员:Mingxiang Teng

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rnaseqcomp”)

PDF	R脚本	rnaseqcomp用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	质量控制,RNASeq,软件,可视化
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.2.0)
进口	RColorBrewer、方法
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/tengmx/rnaseqcomp
全靠我
进口我
建议我	SummarizedBenchmark
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rnaseqcomp_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	rnaseqcomp_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rnaseqcomp_1.16.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseqcomp
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rnaseqcomp
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rnaseqcomp/
软件包下载报告	下载数据