这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rgsepd。
Bioconductor版本:3.10
R / GSEPD是一个生物信息学计划来帮助消除歧义转录组样品(RNA-Seq数的矩阵记录id)通过自动化微分表达式(DESeq2),然后基因集富集(GOSeq),最后一个n维投影量化方法每个样本就像治疗组。
作者:Stamm卡尔
Stamm维护者:卡尔<卡尔。stamm gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“rgsepd”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rgsepd”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“rgsepd”)
R脚本 | 介绍rgsepd包 | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneSetEnrichment,ImmunoOncology,RNASeq,软件 |
版本 | 1.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 3.5.0),DESeq2,goseq(> = 1.28) |
进口 | gplots,biomaRt,org.Hs.eg.db,GO.db,SummarizedExperiment,哈希,AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | 引导、工具、BiocGenerics,knitr,xtable |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | rgsepd_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | rgsepd_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | rgsepd_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rgsepd |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rgsepd |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rgsepd/ |
包下载报告 | 下载数据 |