此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rWikiPathways.
Bioconductor版本:3.10
使用此包与WikiPathways API进行交互。
作者:埃贡·威利哈根[aut, cre],亚历克斯·皮科[au]
维护者:Egon Willighagen < Egon。Willighagen在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“rWikiPathways”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rWikiPathways")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“rWikiPathways”)
超文本标记语言 | R脚本 | 1.概述 |
超文本标记语言 | R脚本 | 2.rWikiPathways和BridgeDbR |
超文本标记语言 | R脚本 | 3.rWikiPathways和RCy3 |
超文本标记语言 | R脚本 | 4.路径分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | GraphAndNetwork,代谢组学,网络,软件,ThirdPartyClient,可视化 |
版本 | 1.6.1 |
在Bioconductor | BioC 3.7 (R-3.5)(2年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | |
进口 | caTools,httr,rjson跑龙套,XML |
链接 | |
建议 | testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/wikipathways/rwikipathways |
BugReports | https://github.com/wikipathways/rwikipathways/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | TRONCO |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | rWikiPathways_1.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | rWikiPathways_1.6.1.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | rWikiPathways_1.6.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rWikiPathways |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rWikiPathways |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rWikiPathways/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |