pvca

DOI:10.18129 / B9.bioc.pvca

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见pvca．

主方差成分分析(PVCA)

Bioconductor版本:3.10

该包包含通过将所有“源”拟合为随机效应，包括混合模型中的双向相互作用项(依赖于lme4包)来评估批处理源的功能，这些主成分是从原始数据相关矩阵中获得的。此包随书“微阵列实验中的批处理效应和噪声，第12章。

作者:Pierre Bushel < Bushel at niehs.nih.gov>

维护者:Jianying LI

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("pvca")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes (pvca)

PDF	R脚本	微阵列数据的批效应估计
PDF		参考手册

细节

biocViews	BatchEffect，微阵列，软件
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(7年)
许可证	LGPL (>= 2.0)
取决于	R (>= 2.15.1)
进口	矩阵，Biobase，vsn统计数据,lme4
链接
建议	golubEsets
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	ExpressionNormalizationWorkflow，proBatch
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	pvca_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	pvca_1.26.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	pvca_1.26.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pvca
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pvca
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pvca/
软件包下载报告	下载数据