此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见proteoQC.
Bioconductor版本:3.10
这个包为基于MS/MS的蛋白质组学数据创建HTML格式的QC报告。该报告旨在让用户快速评估蛋白质组学数据的质量。
作者:博文
维护者:博文<文博在genome .cn>
引文(从R内,输入引用(“proteoQC”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“proteoQC”)
超文本标记语言 | R脚本 | 00 proteoQC简介 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,ReportWriting,软件,可视化 |
版本 | 1.21.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年) |
许可证 | LGPL-2 |
取决于 | R (>= 3.0.0),XML,维恩图,MSnbase |
进口 | rTANDEM,plyr,seqinr,喷嘴。R1,ggplot2,reshape2平行,rpx,tidyr,dplyr,情节,rmarkdown |
链接 | |
建议 | RforProteomics,knitr,BiocStyle,R.utils,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/wenbostar/proteoQC |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | proteoQC_1.21.0.tar.gz |
Windows二进制 | proteoQC_1.21.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | proteoQC_1.21.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proteoQC |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/proteoQC |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/proteoQC/ |
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