proteoQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.proteoQC

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见proteoQC

蛋白质组学数据质量控制的R包

Bioconductor版本:3.10

这个包为基于MS/MS的蛋白质组学数据创建HTML格式的QC报告。该报告旨在让用户快速评估蛋白质组学数据的质量。

作者:博文, Laurent Gatto

维护者:博文<文博在genome .cn>

引文(从R内,输入引用(“proteoQC”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“proteoQC”)

超文本标记语言 R脚本 00 proteoQC简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ImmunoOncologyMassSpectrometry蛋白质组学质量控制ReportWriting软件可视化
版本 1.21.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年)
许可证 LGPL-2
取决于 R (>= 3.0.0),XML维恩图MSnbase
进口 rTANDEMplyrseqinr喷嘴。R1ggplot2reshape2平行,rpxtidyrdplyr情节rmarkdown
链接
建议 RforProteomicsknitrBiocStyleR.utilsRUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/wenbostar/proteoQC
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 proteoQC_1.21.0.tar.gz
Windows二进制 proteoQC_1.21.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) proteoQC_1.21.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proteoQC
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/proteoQC
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/proteoQC/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网