后代
DOI:10.18129 / B9.bioc.progeny
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅后代。
从基因表达通路响应基因活动推理
Bioconductor版本:3.10
这个包提供了一个函数来推断途径活性从使用后代基因表达。它包含线性模型我们推断在出版“Perturbation-response基因揭示信号的足印在癌症基因表达”。
作者:迈克尔·舒伯特< mschu.dev gmail.com >
维护人员:迈克尔·舒伯特< mschu.dev gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“后代”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“后代”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“后代”)
| HTML | R脚本 | narray用法示例 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | FunctionalPrediction,GeneExpression,GeneRegulation,软件,SystemsBiology |
| 版本 | 1.8.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(2.5年) |
| 许可证 | Apache许可(= = 2.0)|文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.4.0) |
| 进口 | Biobase |
| 链接 | |
| 建议 | 气道,biomaRt,BiocFileCache,扫帚,DESeq2,dplyr,knitr,readr,readxl |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/saezlab/progeny |
| BugReports | https://github.com/saezlab/progeny/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | progeny_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | progeny_1.8.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | progeny_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/progeny |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/后代 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/progeny/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
