procoil

DOI:10.18129 / B9.bioc.procoil

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见procoil

螺旋蛋白的寡聚化预测

Bioconductor版本:3.10

该包允许预测一个卷曲的线圈序列(氨基酸序列加上七tad寄存器)更有可能形成二聚体或更有可能形成三聚体。除了预测本身之外,还计算了一个预测配置文件,以确定单个残差对任何一类都具有指示性的强度。预测配置文件也可以可视化为曲线或热图。

作者:Ulrich Bodenhofer

维护者:Ulrich Bodenhofer < Bodenhofer at bioinf.jku.at>

引文(从R内,输入引用(“procoil”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("procoil")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“procoil”)

PDF R脚本 PrOCoil -一个Web服务和R包预测线圈蛋白的寡聚
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类蛋白质组学软件SupportVectorMachine
版本 2.14.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(9年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.3.0),烤肉串
进口 方法,统计,图形,S4VectorsBiostrings,跑龙套
链接
建议 knitr
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bioinf.jku.at/software/procoil/https://github.com/UBod/procoil
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 procoil_2.14.0.tar.gz
Windows二进制 procoil_2.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) procoil_2.14.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/procoil
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/procoil
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/procoil/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网