plyranges

DOI:10.18129 / B9.bioc.plyranges

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见plyranges．

一个操作基因组序列的流畅界面

Bioconductor版本:3.10

用于与常见的Bioconductor类Ranges和genomic icranges进行交互的类dplyr接口。通过提供操作这些类的语法和一致的方式，有望增加新Bioconductor用户的可访问性。

作者:斯图尔特·李[aut, cre]，迈克尔·劳伦斯[aut, ctb]，黛安·库克[aut, ctb]

维护人员:Stuart Lee < Lee。年代在wehi.edu.au >

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("plyranges")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“plyranges”)

超文本标记语言	R脚本	简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，DataRepresentation，基础设施，软件，WorkflowStep
版本	1.6.10
Bioconductor自	BioC 3.7 (R-3.5)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5),BiocGenerics，IRanges(> = 2.12.0),GenomicRanges(> = 1.28.4)
进口	方法,dplyr，rlang(> = 0.2.0),magrittr，tidyselect(> = 1.0.0),rtracklayer，GenomicAlignments，GenomeInfoDb，Rsamtools，S4Vectors(> = 0.23.10),跑龙套
链接
建议	knitr，BiocStyle，rmarkdown，testthat(> =魅惑,HelloRanges，HelloRangesData，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，pasillaBamSubset，covr，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/sa-lee/plyranges
取决于我
进口我	BUSpaRse，methylCC
建议我	StructuralVariantAnnotation
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	plyranges_1.6.10.tar.gz
Windows二进制	plyranges_1.6.10.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	plyranges_1.6.10.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ plyranges
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/plyranges/
包下载报告	下载数据