管框
doi：10.18129/b9.bioc.pipeframe
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅管框。
R中生物信息学的管道框架
生物导体版本：3.10
PipeFrame是用于构建组成生物信息学管道的R软件包。该管道中的每个步骤都包裹在框架中，因此步骤之间的连接是无缝和自动创建的。用户可以更多地专注于微调参数，而不是花费大量时间来转换文件格式，将任务输出传递给任务输入或安装依赖项。组件的步骤元素也可以灵活地定制到其他新管道中。该管道可以分为几个重要的功能步骤，因此用户更容易从每个步骤中理解复杂的参数，而不是整个管道中的参数组合。同时，组件的管道可以在断点处重新启动，并避免重新启动整个管道，这可能为管道调整的用户节省大量时间，或者诸如关闭电源或处理其他中断等问题。
作者：Zheng Wei，闪亮的硕士
维护者：Zheng Wei
引用（从r内，输入引用（“ PipeFrame”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ pipeframe”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ PipeFrame”）
| html | R脚本 | 管框的简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 基础设施，，，，软件，，，，工作流程 |
| 版本 | 1.2.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（1年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | |
| 进口 | BSGENOME，，，，消化，，，，Visnetwork，，，，马格里特， 方法，生物弦，，，，GenomeInfodB，并行，统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | 生物管理器，，，，尼特，，，，rtracklayer，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/wzthu/pipeframe |
| BugReports | https://github.com/wzthu/pipeframe/issues |
| 取决于我 | 富集 |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | PipeFrame_1.2.2.2.tar.gz |
| Windows二进制 | PipeFrame_1.2.2.2.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | pipeframe_1.2.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pipeframe |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/pipeframe |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pipeframe/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
