钢琴

DOI:10.18129 / b9.bioc.piano

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅钢琴

omics数据综合分析平台

生物导体版本:3.10

钢琴使用各种统计方法进行基因集分析,来自不同基因水平统计和各种基因集收集。此外,钢琴包包含用于组合多次基因集分析结果的功能。

作者:Leif varemo wigge intawat nookaew

维护者:Leif varemo wigge

引文(从R内,输入引文(“钢琴”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“3.6”)并输入:

if(!procennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“钢琴”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

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Browsevignettes(“钢琴”)

PDF. r script. 钢琴 - OMICS数据综合分析平台
HTML. r script. 用钢琴运行基因集AAYSESIS
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 不同的亚兴基因表达GenesetenRichment.微阵列途径预处理QualityControl.软件可视化
版本 2.2.0
在生物导体中以来 BIOC 2.12(R-3.0)(7年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 r(> = 3.5)
进口 生物根系BioBase.贡献iGraph.关系马拉莱FGSEA.闪亮的DT.HTMLWidgets.Shinyjs.Shinydashboardvisnetwork.,grdevices,图形,统计数据,utils,方法
链接到
建议 yeast2.db.rsbml.Plotrix.林马敬服plaffyplm.GTOOLS.生物雕annotationdbi.knRAMAMAMDOW.生物焦
系统要求
加强
URL. http://www.sysbio.se/piano.
Bugreports. https://github.com/varemo/piano/issues.
取决于我
进口我 Pharmacogx.
建议我 Bloodcancermultiomics2017
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 钢琴_2.2.0.tar.gz.
Windows二进制文件 钢琴_2.2.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) 钢琴_2.2.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/piano.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/钢琴
包短网址 https://biocumon.org/packages/piano/
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