此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅钢琴。
生物导体版本:3.10
钢琴使用各种统计方法进行基因集分析,来自不同基因水平统计和各种基因集收集。此外,钢琴包包含用于组合多次基因集分析结果的功能。
作者:Leif varemo wigge
维护者:Leif varemo wigge
引文(从R内,输入引文(“钢琴”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“3.6”)并输入:
if(!procennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“钢琴”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“钢琴”)
PDF. | r script. | 钢琴 - OMICS数据综合分析平台 |
HTML. | r script. | 用钢琴运行基因集AAYSESIS |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 不同的亚兴那基因表达那GenesetenRichment.那微阵列那途径那预处理那QualityControl.那软件那可视化 |
版本 | 2.2.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.12(R-3.0)(7年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | r(> = 3.5) |
进口 | 生物根系那BioBase.那贡献那iGraph.那关系那马拉莱那FGSEA.那闪亮的那DT.那HTMLWidgets.那Shinyjs.那Shinydashboard那visnetwork.那秤,grdevices,图形,统计数据,utils,方法 |
链接到 | |
建议 | yeast2.db.那rsbml.那Plotrix.那林马那敬服那pl那affyplm.那GTOOLS.那生物雕那雪那annotationdbi.那kn那RAMAMAMDOW.那生物焦 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | http://www.sysbio.se/piano. |
Bugreports. | https://github.com/varemo/piano/issues. |
取决于我 | |
进口我 | Pharmacogx. |
建议我 | Bloodcancermultiomics2017 |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | 钢琴_2.2.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | 钢琴_2.2.0.zip. |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | 钢琴_2.2.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/piano. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包装/钢琴 |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/piano/ |
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