pdInfoBuilder

DOI:10.18129 / B9.bioc.pdInfoBuilder

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pdInfoBuilder。

平台设计信息包生成器

Bioconductor版本:3.10

构建信息平台设计方案。这些由一个SQLite数据库(包含特性数据,如x, y位置芯片和featureSet ID。数据库也包含featureSet-level注释数据。这个包的产品使用的低聚糖包裹。

作者:赛斯猎鹰,文斯·凯里,马特落定,克里斯托夫单词de Beuf Benilton卡瓦略

维护人员:Benilton卡瓦略< Benilton在unicamp.br >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pdInfoBuilder”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“pdInfoBuilder”)

PDF		建筑与pdInfoBuilder注释包使用益生元包
PDF	R脚本	PDInfo包构建Affymetrix映射芯片
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,基础设施,软件
版本	1.50.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(13岁)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.2.0)、方法Biobase(> = 2.27.3),RSQLite(> = 1.0.0),affxparser(> = 1.39.4),益生元(> = 1.31.5)
进口	Biostrings(> = 2.35.12),BiocGenerics(> = 0.13.11),DBI(> = 0.3.1),IRanges(> = 2.1.43),oligoClasses(> = 1.29.6),S4Vectors(> = 0.5.22)
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	maqcExpression4plex
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	pdInfoBuilder_1.50.0.tar.gz
Windows二进制	pdInfoBuilder_1.50.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	pdInfoBuilder_1.50.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pdInfoBuilder
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pdInfoBuilder
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pdInfoBuilder/
包下载报告	下载数据