PCOT2

doi:10.18129/b9.bioc.pcot2

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅PCOT2

主要坐标和Hotelling的T-Square方法

生物导体版本:3.10

PCOT2是一种基于置换的方法,用于研究多基因网络活动的变化。它利用基因间相关信息来检测基因网络活动的重大变化。目前,它可以应用于两样本比较。

作者:莎拉·宋,米克·布莱克

维护者:Sarah Song

引用(从r内,输入引用(“ PCOT2”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pcot2”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ pcot2”)

PDF R脚本 PCOT2 VIGNETTE
PDF 参考手册

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,kegg,,,,微阵列,,,,网络,,,,软件
版本 1.54.0
在生物导体中 Bioc 1.9(R-2.4)(13。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.0.0),grdevices,生物酶,,,,一张地图
进口
链接
建议 多检验,,,,Hu6800.db,,,,kegg.db,,,,mvtnorm
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 PCOT2_1.54.0.TAR.GZ
Windows二进制 PCOT2_1.54.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) PCOT2_1.54.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcot2
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pcot2
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/pcot2/
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