pcaGoPromoter

DOI:10.18129 / B9.bioc.pcaGoPromoter

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pcaGoPromoter。

pcaGoPromoter用于分析DNA微阵列数据

Bioconductor版本:3.10

这个包包含函数来减轻DNA微阵列的分析。它利用主成分分析作为初始多元分析,其次是主成分的功能解释维度与传播的分析条件和监管解释使用群体分析恢复最初的转录因子结合位点预测算法。

作者:Morten汉森(Jorgen奥尔森

维护人员:Morten汉森< mhansen在sund.ku.dk >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pcaGoPromoter”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“pcaGoPromoter”)

PDF	R脚本	pcaGoPromoter
PDF		参考手册

细节

biocViews	去,GeneExpression,微阵列,软件,可视化
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 2.10 (r - 2.15)(8年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.14.0),椭圆,Biostrings
进口	AnnotationDbi
链接
建议	Rgraphviz,GO.db,hgu133plus2.db,mouse4302.db,rat2302.db,hugene10sttranscriptcluster.db,mogene10sttranscriptcluster.db,pcaGoPromoter.Hs.hg19,pcaGoPromoter.Mm.mm9,pcaGoPromoter.Rn.rn4,serumStimulation、并行
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	pcaGoPromoter_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	pcaGoPromoter_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	pcaGoPromoter_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcaGoPromoter
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pcaGoPromoter
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pcaGoPromoter/
包下载报告	下载数据