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DOI:10.18129 / B9.bioc.pathprint
这个包是3.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本，请参见pathprint。
基因表达阵列分析的通路指纹图谱
Bioconductor版本:3.10
将作为表达式表或GEO引用提供的基因表达数组转换为“路径指纹”的算法，“路径指纹”是一组路径中表示高(1)、低(-1)或不重要(0)表达的离散三元分数向量。
作者:Gabriel Altschuler, Sokratis Kariotis
维护者:Sokratis Kariotis
引文(从R中输入引用(“pathprint”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install("pathprint")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“pathprint”)
| R脚本 | pathprint | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,KEGG,Reactome,软件,转录 |
| 版本 | 1.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (R-3.4)(3年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | 统计,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | 所有,GEOquery,pathprintGEOData,SummarizedExperiment |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | pathprintGEOData |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | pathprint_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | pathprint_1.16.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | pathprint_1.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathprint |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pathprint |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pathprint/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
