此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅锅。
生物导体版本:3.10
基于从伴侣注释中得出的距离量匹配探针(NSMP)的距离(NSMP)的距离来制作基因存在/不存在的函数。在创建基因表达值之后应用PANP,因此可以在任何预处理方法(例如MAS5或GCRMA)或RMA之类的PM-PM方法之后使用。迄今为止,已经为HGU133A和HGU133-PLUS-2.0芯片组建立了NSMP集。
作者:彼得·沃伦
维护者:彼得·沃伦(Peter Warren)
引用(从r内,输入引用(“ panp”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ panp”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ panp”)
R脚本 | 基因存在/不存在 | |
参考手册 |
生物浏览 | 基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.56.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.8(R-2.3)(14年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.10),副词(> = 1.23.4),生物酶(> = 2.5.5) |
进口 | 生物酶,方法,统计,utils |
链接 | |
建议 | GCRMA |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | panp_1.56.0.tar.gz |
Windows二进制 | panp_1.56.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | panp_1.56.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/panp |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/panp |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/panp/ |
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