oppti

DOI:10.18129 / B9.bioc.oppti

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅oppti。

异常蛋白质和Phosphosite目标标识符

Bioconductor版本:3.10

oppti的目的是分析蛋白质(和phosphosite)表达式找到边远标记为每个样品在给定队列(s)个性化的发现可操作的目标。

作者:Abdulkadir埃尔玛

维护人员:Abdulkadir埃尔玛< Abdulkadir。埃尔玛在mssm.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“oppti”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML	R脚本	异常蛋白质和Phosphosite目标标识符
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文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,DifferentialExpression,GeneExpression,GeneTarget,网络,蛋白质组学,回归,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(< 6个月)
许可证	麻省理工学院
取决于	R (> = 3.6)
进口	limma统计数据,重塑,ggplot2grDevices,RColorBrewer,pheatmap,knitr、方法、devtools
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Huang-lab/oppti
BugReports	https://github.com/Huang-lab/oppti/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	oppti_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	oppti_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	oppti_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oppti
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ oppti
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/oppti/
包下载报告	下载数据