openCyto

DOI:10.18129 / B9.bioc.openCyto

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见openCyto

用于流式细胞仪数据的分层门控管道

Bioconductor版本:3.10

该包的设计是为了方便自动门控方法以顺序方式模拟手动门控策略。

作者:Mike Jiang, John Ramey, Greg Finak, Raphael Gottardo

维护者:Mike Jiang

引文(从R内,输入引用(“openCyto”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("openCyto")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“openCyto”)

超文本标记语言 R脚本 openCyto包简介
超文本标记语言 R脚本 如何使用不同的自动门控功能
超文本标记语言 R脚本 如何写一个csv门控模板
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportDataRepresentationFlowCytometryImmunoOncology预处理软件
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(6.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.5.0)
进口 方法,BiobaseBiocGenericsgtoolsflowCore(> = 1.31.17),flowVizncdfFlow(> = 2.11.34),flowWorkspace(> = 3.33.1),flowStats(> = 3.29.1),flowClust(> = 3.11.4),质量线索plyrRBGLdata.tableksRColorBrewer晶格rrcovR.utils
链接 Rcpp
建议 flowWorkspaceDataknitrtestthat, utils,工具,并行,ggcytoCytoML
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 CytoML
建议我 flowClustflowCoreflowStatsflowWorkspaceggcyto
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 openCyto_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 openCyto_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) openCyto_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/openCyto
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/openCyto
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/openCyto/
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