Ontoproc

doi:10.18129/b9.bioc.ontoproc

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Ontoproc

解剖学,细胞系等本体的处理

生物导体版本:3.10

支持收集各种生物信息学本体论,特别是在Cran上使用了OntologyIndex软件包。我们提供有关细胞,细胞系,化合物和解剖结构术语的关键本体论的快照,以帮助分析基因组规模实验,尤其是细胞X化合物筛选。另一个目的是加强引人注目的用例开发,以使其富裕的界面成为新的本体论。

作者:Vince Carey

维护者:vj Carey

引用(从r内,输入引用(“ Ontoproc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ontoproc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Ontoproc”)

html R脚本 ONTOPROC:一些面向本体的用单细胞焦点用于生物导体
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 ,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.8.1
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(2。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.5),Ontology Indexex
进口 生物酶,,,,S4VECTORS, 方法,AnnotationDbi,统计,utils,闪亮的,,,,图形,,,,rgraphviz,,,,本体学图,,,,dplyr,,,,马格里特
链接
建议 尼特,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,测试,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 pogos,,,,tenxplore
建议我 Bioconcotk,,,,txreginfra
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ontoproc_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 ontoproc_1.8.1.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) ontoproc_1.8.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ontoproc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/ontoproc
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ontoproc/
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