oneSENSE

DOI:10.18129 / B9.bioc.oneSENSE

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅oneSENSE。

一维Soli-Expression非线性随机嵌入(OneSENSE)

Bioconductor版本:3.10

一个图形用户界面,方便了降维方法基于t-distributed随机邻居嵌入(t-SNE)算法,分类分析大规模血细胞计数数据。某种意义上,测量参数分为预定义类别,和细胞投射到每个类别的空间组成的一个维度。每个维度信息,可以通过使用注释heatplots对齐的平行轴,同时允许可视化两个陆续在一个二维图。细胞产生的情节alllows入住率直接评估类别之间的关系。

作者:程杨、埃文·纽厄尔永凯被晒黑

维护人员:永凯Tan < yongkee。在gmail.com t >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“oneSENSE”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“oneSENSE”)

HTML	R脚本	介绍oneSENSE GUI
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DimensionReduction,FlowCytometry,GUI,ImmunoOncology,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(2.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.4),webshot,闪亮的,shinyFiles,scatterplot3d
进口	Rtsne,情节,gplots跑龙套grDevices图形,统计数据,方法,flowCore
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	oneSENSE_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	oneSENSE_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	oneSENSE_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oneSENSE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ oneSENSE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/oneSENSE/
包下载报告	下载数据