乘

DOI:10.18129 / B9.bioc.multtest

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见乘．

基于重采样的多重假设检验

Bioconductor版本:3.10

基于非参数自举和排列重采样的多重测试程序(包括经验贝叶斯方法)，用于控制全族错误率(FWER)、广义全族错误率(gwer)、假阳性比例的尾概率(TPPFP)和假发现率(FDR)。实现了基于引导的空分布的几种选择(居中、居中和缩放、分位数转换)。可以使用单步方法和分步方法。包括基于各种t-和f -统计量(包括基于线性和生存模型回归参数的t-统计量以及基于相关参数的t-统计量)的检验。当用t-统计量探测假设时，用户也可以选择一个可能更快的零分布，它是均值为零的多元正态分布，方差协方差矩阵来自向量影响函数。结果以调整后的p值、置信区域和检验统计量截断来报告。该方法可直接应用于DNA微阵列实验中差异表达基因的鉴定。

作者:Katherine S. Pollard, Houston N. Gilbert, Yongchao Ge, Sandra Taylor, Sandrine Dudoit

维护者:Katherine S. Pollard < Katherine。Pollard在gladstone.ucsf.edu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("multtest")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，微阵列，MultipleComparison，软件
版本	2.42.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15年)
许可证	LGPL
取决于	R(>= 2.10)，方法，BiocGenerics，Biobase
进口	生存，质量, stats4
链接
建议	雪
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	a4Base，aCGH，BicARE，iPAC，KCsmart，LMGene，PREDA，雨，REDseq，SAGx，siggenes，webbioc
进口我	ABarray，aCGH，adSplit，ALDEx2，anota，anota2seq，ChIPpeakAnno，IsoGeneGUI，KnowSeq，mAPKL，metabomxtr，nethet，OCplus，phyloseq，REDseq，RTopper，singleCellTK，synapter，webbioc，xcms
建议我	annaffy，BiocCaseStudies，ecolitk，factDesign，GGtools，GOstats，gQTLstats，GSEAlm，maigesPack，MmPalateMiRNA，pcot2，ropls，topGO
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	multtest_2.42.0.tar.gz
Windows二进制	multtest_2.42.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	multtest_2.42.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multtest
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/multtest
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/multtest/
软件包下载报告	下载数据