multiMiR

DOI:10.18129 / B9.bioc.multiMiR

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见multiMiR．

整合多种microrna靶标数据库及其疾病和药物关联

Bioconductor版本:3.10

来自外部资源的microrna /靶标的集合，包括验证的microrna靶标数据库(miRecords, miRTarBase和TarBase)，预测的microrna靶标数据库(DIANA-microT, ElMMo, microcosmos, miRanda, miRDB, PicTar, PITA和TargetScan)和microrna疾病/药物数据库(miR2Disease, Pharmaco-miR VerSe和PhenomiR)。

作者:Ru元彬[aut]， Matt Mulvahill [cre, aut]， Spencer Mahaffey [aut]， Katerina Kechris [aut, cph, ths]

维护者:Matt Mulvahill < Matt。Mulvahill在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("multiMiR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“multiMiR”)

超文本标记语言	R脚本	多红外用户指南
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	Homo_sapiens_Data，Mus_musculus_Data，OrganismData，Rattus_norvegicus_Data，软件，miRNAData
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(2.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.4)
进口	统计数据,XML，RCurl，purrr(> = 0.2.2),宠物猫(>= 1.2)，方法BiocGenerics，AnnotationDbi，dplyr
链接
建议	BiocStyle，刨边机，knitr，rmarkdown，testthat(> = 1.0.2中)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/KechrisLab/multiMiR
BugReports	https://github.com/KechrisLab/multiMiR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	multiMiR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	multiMiR_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	multiMiR_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiMiR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/multiMiR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/multiMiR/
软件包下载报告	下载数据