multiMiR

DOI:10.18129 / B9.bioc.multiMiR

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见multiMiR

整合多种microrna靶标数据库及其疾病和药物关联

Bioconductor版本:3.10

来自外部资源的microrna /靶标的集合,包括验证的microrna靶标数据库(miRecords, miRTarBase和TarBase),预测的microrna靶标数据库(DIANA-microT, ElMMo, microcosmos, miRanda, miRDB, PicTar, PITA和TargetScan)和microrna疾病/药物数据库(miR2Disease, Pharmaco-miR VerSe和PhenomiR)。

作者:Ru元彬[aut], Matt Mulvahill [cre, aut], Spencer Mahaffey [aut], Katerina Kechris [aut, cph, ths]

维护者:Matt Mulvahill < Matt。Mulvahill在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“multiMiR”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("multiMiR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“multiMiR”)

超文本标记语言 R脚本 多红外用户指南
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews Homo_sapiens_DataMus_musculus_DataOrganismDataRattus_norvegicus_Data软件miRNAData
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(2.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.4)
进口 统计数据,XMLRCurlpurrr(> = 0.2.2),宠物猫(>= 1.2),方法BiocGenericsAnnotationDbidplyr
链接
建议 BiocStyle刨边机knitrrmarkdowntestthat(> = 1.0.2中)
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/KechrisLab/multiMiR
BugReports https://github.com/KechrisLab/multiMiR/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 multiMiR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 multiMiR_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) multiMiR_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiMiR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/multiMiR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/multiMiR/
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