msmsEDA

DOI:10.18129 / B9.bioc.msmsEDA

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见msmsEDA．

光谱计数对LC-MS/MS数据的探索性分析

Bioconductor版本:3.10

探索性数据分析，以评估一组LC-MS/MS实验的质量，并可视化去除相关因素的影响。

作者:约瑟普·格雷戈里、亚历克斯·桑切斯和约瑟普·维兰纽瓦

维护者:Josep Gregori < Josep。格雷戈里在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("msmsEDA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“msmsEDA”)

PDF	R脚本	msmsEDA: lc - mms实验中的批效应检测
PDF		参考手册

细节

biocViews	ImmunoOncology，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(6.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.0.1)，MSnbase
进口	质量，gplots，RColorBrewer
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	msmsTests
进口我
建议我	哈曼，RforProteomics
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	msmsEDA_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	msmsEDA_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	msmsEDA_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msmsEDA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/msmsEDA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/msmsEDA/
软件包下载报告	下载数据