MSGBSR

doi:10.18129/b9.bioc.msgbsr

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅MSGBSR

MSGBSR:测序(MS-GB)R函数甲基化敏感基因分型

生物导体版本:3.10

MS-GBS实验的Anaysis的管道。

作者:本杰明·梅恩

维护者:本杰明·梅恩(Benjamin Mayne)

引用(从r内,输入引用(“ MSGBSR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ msgbsr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ msgbsr”)

PDF R脚本 msgbsr_example
PDF 参考手册

细节

生物浏览 DataImport,,,,差甲基化,,,,表观遗传学,,,,免疫学,,,,甲基,,,,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(3年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.4),基因组机, 方法
进口 BSGENOME,,,,EasyRnaseq,,,,EDGER,,,,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,GenomeInfodB,,,,GGBIO,,,,GGPLOT2,,,,iranges, 平行,plyr,,,,rsamtools,,,,r.utils,统计总结性特征,,,,S4VECTORS,UTILS
链接
建议 roxygen2,,,,bsgenome.rnorvegicus.ucsc.rn6
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 msgbsr_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 MSGBSR_1.10.0.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) MSGBSR_1.10.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msgbsr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/msgbsr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/msgbsr/
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