motifStack

DOI:10.18129 / B9.bioc.motifStack

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅motifStack

情节堆叠标识为单个或多个DNA, RNA和氨基酸序列

Bioconductor版本:3.10

motifStack包是专为多个主题和不同的相似性得分的图形表示。它的工作原理与DNA / RNA序列基序和氨基酸序列基序。此外,它为用户提供了灵活的自定义图形参数,比如字体类型和颜色的象征。

作者:Jianhong Ou,苏格兰人迈克尔•布罗斯基沃尔夫和丽华朱莉朱

维护人员:Jianhong Ou <,或者在duke.edu >

从内部引用(R,回车引用(“motifStack”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“motifStack”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“motifStack”)

HTML R脚本 motifStack装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐,ChIPSeq,ChIPchip,DataImport,微阵列,MotifAnnotation,SequenceMatching,测序,软件,可视化
版本 1.30.0
Bioconductor自 BioC 2.11 (r - 2.15)(7.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(> = 2.15.1)、方法grImport2、网格MotIV,ade4,Biostrings
进口 XML,尺度,htmlwidgets,统计grDevices stats4,图形,跑龙套,ggplot2
链接
建议 RUnit,BiocGenerics,MotifDb,RColorBrewer,BiocStyle,knitr,httr,htmltools
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 dagLogo,generegulation
进口我 ATACseqQC,atSNP,LowMACA,motifbreakR,TCGAWorkflow
建议我 ChIPpeakAnno,TFutils,universalmotif
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 motifStack_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 motifStack_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) motifStack_1.30.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motifStack
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ motifStack
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/motifStack/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网