motifRG

DOI:10.18129 / B9.bioc.motifRG

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅motifRG。

歧视主题发现包,专为高通量测序数据集

Bioconductor版本:3.10

工具有识别力的主题发现用回归的方法

作者:Zizhen么

维护人员:Zizhen么< yzizhen fhcrc.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“motifRG”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“motifRG”)

PDF	R脚本	motifRG:回归歧视主题的发现
PDF		参考手册

细节

biocViews	MotifDiscovery,软件,转录
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 2.10 (r - 2.15)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.15),Biostrings(> = 2.26),IRanges,seqLogo、平行、方法、网格图形,BSgenome,XVector,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
进口	Biostrings,IRanges,seqLogo、平行、方法、网格图形,XVector
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	美国广播公司
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	motifRG_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	motifRG_1.30.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	motifRG_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motifRG
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ motifRG
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/motifRG/
包下载报告	下载数据